Boston dag 3

5/11-2011

Dagen invigdes med frukost och opening ceremony som hölls av söta Randy. Randy är självaste överhuvudet och det märks när han talar att han är helt förälskad i vad han åstadkommit. Talet var lite liknande det som hölls i Amsterdam men minst lika mäktigt ändå. Efter detta gick på första presentationen som hölls av team Munich, intressant men inte lika bra som vårt projekt ;) 

Dagen bestod mest av repetition och finslip av presentation skills, alltså öva, öva och fortsätta öva men självklart gick vi och lyssna på andras presentationer också. Klockan 18 började poster session och detta är ett tillfälle då man får mingla runt bland andra studenter, prata om sitt egna projekt och lyssna på andras. Sjukt kul och kreativiteten är enorm. 

Testresultat

Målet med hela vårt iGEM-projekt i år var att bygga tre system i bakterier som uttrycker var sin färg (röd, grön och blå) när man belyser dem med ljus. Den amerikanska forskaren Chris Voigh publicerade förra året en artikel om genreglering genom ljus, vilket vi baserade vår forskning om. Dock omfattade Voighs system endast röd och grön medan vårt även innehåller blå. Våra bakterier innehåller även pigment (färg), som ska uttryckas när de belyses. Precis innan vi åkte från Sverige så ställde vi upp en testanordning för att testa våra sensorer, och den blå visade resultat:

Boston dag 2

Igår anlände vi i Boston, trötta efter den lååånga flygresan. Så snart vi kom fram tog vi taxi till hotellet (Marriott hotel) som är väldigt fint och nära Campus. Taxiresan var en upplevelse i sig, chauffören var väldigt skum och vi tror att han blåste oss på cash. Anyway, idag befinner vi oss på självaste MIT, vi har hittat en sal där vi ska fixa det sista med presentationen. Vi ska också repetera inför presentationen som ska hållas på sön och poster presentationen som är redan i morgon. MIT är grymt stort och vackert, här nedan kommer några bilder från resan hittills, mer kommer!

Utsikt från hotellet, 8onde våningen

Skål Erik! Frukost på hotellet

På väg till Campus

Sitting in the sun =)

Den undangömda salen

Slutet är nära...

Imorgon är det sista dagen som vi kan redigera och uppdatera vår hemsida (http://2011.igem.org/Team:Uppsala-Sweden) för att på lördag kl 06.00 är det den andra och sista wiki-freeze. Inom mindre än en vecka så kommer åtta av oss samt proffessor Anders Virtanen och vår handledare Erik Gullberg att åka till MIT och representera Uppsala-Sweden! Spännande!

Utöver detta så har TekNat-fakulteten skickat en förfrågan till oss om vi vill vara med i en reklam film för TekNat och Uppsala Universitet. Detta låter hemskt lockande, men vi måste diskutera detta som en grupp innan vi bestämmer oss.

En annan sak som är aktuell är även att vi kommer att ha en monter på Genvägen, som är en mässa under bioteknikdagarna för bioteknikstudenter runt om i landet. Eftersom iGEM 2011 är över vid den tiden, så blir det ett utmärkt tillfälle att sprida kunskap om iGEM i Sverige samt rekrytera nya studenter till nästa års lag.

Tillbakablick II: En sommar i ett lab

Uppsala Nya Tidning

I somras skrev UNT en artikel om oss och nu i helgen publicerades en ny artikel om oss och vår kvalificering till MIT, Boston.

http://www.unt.se/uppsala/uppsalastudenter-tog-guld-1485708.aspx

Aftermath

Nu är vi hemma i Sverige igen och igår hade vi möte för att diskutera hur vi ska gå vidare och vad vi ska fokusera på och förbättra innan vi åker till MIT. Idag ska vi prata med IBG så att vi kan få en lablokal att hålla till i. I väntan på svar så fokuserar vi på skolan, vi trots allt heltidsstuderande.

Domarnas åsikt

Uppsala-Sweden – Expand the Coliroids into Colorful Light Sensing

A bacterial photocopy machine? They must be out of their mind. It must have something to do with light sensors and color expression. Judging by the Uppsala teams colorful t-shirts they sure know what they are talking about!
They presentation introduction is like a ceremony taking place. The presenter introduces the topic and principle goals as if he is announcing a dramatic news item. It is clear and crisps what the Uppsala team wants to achieve.
A blue light sensor (YF1) is shown on the screen after a rapid animation that triggers a mild laugh in the room. The blue light sensor is a new addition to the already existing red and green light sensors in the Registry. All three sensors are proposed to be transformed into the same cell, coupled to their own expression cassette for the production of the associated color.
All together the team wanted to insert a great amount of basepairs they chose to incorporate the genes into the bacterial genome. For this they used the Lamba red assembly system. Despite a nice full overview of the technique, this approach has not been fully characterized yet. Future teams can pick up this task, because the Lamba red plasmid is now available in the Registry.
Btw, contrarily to using the red light sensor from the registry, the team got the sensor from the authors of the original paper. They succesfully removed the illegal restriction sites as well. So, for those of you ever planning to use this sensor: please contact Uppsala.
Summarizing, it was a colorful presentation with an interesting Q&A session afterwards. A bacterial photocopier still seems to be a bridge to far, but to say the least this is a proper foundation.

http://2011.igem.org/Regions/Europe/Jamboree/Blog

Guld, final och glädjerus

VI HAR GÅTT VIDARE TILL BOSTON!!!

Regional Jamboree dag 1

Dagen har varit bra, vi har tittat på andra lags presentationer samt hållt en själva. Förhoppningarna är stora! Bilder från dagen:

Vrije Universiteit

Vi delade upp oss i två grupper, den ena gruppen åkte iväg till Vrije Universiteit för att leta reda på lokaler samt hämta ett start paket medan de andra stannade på hostlet och övade på presenatioen. Kvällsmat bjöd universitetet på. På vägen mot vårt grupprum, som vi hade bokat för att öva i, träffade vi Sture Henckel, reporten från tidingen Ingenjören som kommer att följa oss i Amsterdam. Efteråt gick vi till aulan som vi kommer att vara i imorgon och övade lite till. Jämför med vad vår presenation var tidigare i veckan, så är den absolut bätte och bra nu. Hoppas det går bra imorgon!

Övning ger färdighet

Igår tog vi större delen av dagen ledigt och gick vi runt och tittade på Amsterdams gator. Idag arbetar vi med att färdigställa och öva på presentationen så den sitter som handsken imorgon. Just nu sitter i rummet på vårt hostel och Lei, Lidaw och Antonio övar medan vi andra agerar som publik. Miljön här är nog inte den ultimata, men just nu övar vi på att prata till vår presentations slide så det går bra ändå. Vårt mål är att när vi åker till Vrije Universiteit senare idag, och får va i en mer verklig miljö, så ska presentationen vara så bra att vi bara behöver finslipa på detaljerna.

Dag 1, Amsterdam

Hej gott folk!
Resan till Amsterdam startade klockan 05.20 då bussen avgick från Uppsala. Nu är klockan 22.30 och Erik mr supervisor kom precis hit till vårt hostel =D Idag har vi mest kollat läget runt på stan och ätit god mat. Därefter ska vi fixa det sista med presentationen och i morgon kväll ska vi åka till Vrije Universiteit för att öva på presentationen i mer verklig miljö. Hörs imorgon!!

Hungriga iGEMers

På torget i Amsterdam =)

Genrep

Idag har vi haft genrep av vår presentation inför tävlingen på lördag. Vi fick många bra kommentarer och förslag men det verkar bli en lång kväll för mycket behövs ändras. Lidaw, Lei och Antonio som ska hålla i presentationen skötte sig jätte bra och vi andra är säkra på att de kommer göra ett jätte bra jobb i Amsterdam.

Det börjar närma sig Jamboreen, bara 4 dagar kvar!! Vi väntar fortfarande spänt på att våra t-shirts ska komma och förhoppningsvis kommer de i morgon. Postern skickades in idag och i morgon har vi den utskriven.

Guldmedaljen är nära nu, vi kan till och med känna lukten (hur luktar guld?)
=)

λ-red och diskussion

På kvällen hade vår handledare Erik Gullberg en efterfrågad föreläsning om  λ-red, en metod för att få in DNA fragment i kromosomen. Efteråt började vi att titta igenom och korrigera planschen och presentationen som vi ha när vi åker till Amsterdam på torsdag. I början kändes delfinalen i Amsterdam väldigt långt bort och nu är det bara några få dagar kvar. Tiden börjar bli knapp. Vi är alla upptagna med skolan under dagen så det blir många sena kvällar med iGEM under kvällen. Det är inte så roligt att komma hem sent flera dagar i vecken, men vi är en härlig grupp som har roligt tillsammans.

Igge igelkott och Lei i kafeterians trädgård



Hemlösa

Eftersom en kurs ska börja använda labbet som vi har varit i så var vi igår tvugna att städa ur labbet och slänga massa gamla agarplattor. Man tror inte att det tar så lång tid, men det tog några timmar ändå. Samtidigt som det kändes det jobbigt att slänga så mycket så var det lättande, som att rensa ut alla gamla kläder i en garderob.

Så här brukar det se ut:

Så här såg det ut imorse:



Måndags skämt

When we get to Amsterdam and they ask us how we managed to get so much done, we'll tell them that when you are 18 there's a lot more you can do.

Tillbakablick: möten och planering

Att delta i iGEM har krävt mycket planering, tid och hängivenhet. Nedanför är några bilder från i våras när vi brukade träffas efter skolan för att diskutera och planera vårt projekt.

Ingenjören och Ångström

Idag är det 6 dagar kvar tills vi åker till Amsterdam. I onsdags frös de vår hemsida (http://2011.igem.org/Team:Uppsala-Sweden) så att dommarna kunde påbörja sitt arbete. Vi har sedan dess fokuserat på att förbereda oss inför delfinalen i Amsterdam, som vi ser mycket fram emot.



Idag har vi fått besök i labbet av en reporter från Ingenjören! Han kommer att åka med oss till Amsterdam och följa oss under jamboreen. Han verkade väldigt intresserad, vilket vi tycker är väldigt roligt.



Vi har även gjort ett besök hos Rein Maripuu, en forskare vid Institutionen för Fysik och Astronomi. Han byggde oss ett lysdiod-kretskort med röd, grön och blå lysdioder. Vi fick låna kretskortet för att testa våra bakterier stammar vi gjorde på BMC. Denna gång testar vi med den blåa lysdioden. Hoppas att våra bakterier blir blåa imorgon!

Deadline - Wiki Freeze

Klockan var 03:46 och här arbetar vi för fullt med att färdigställa, både layout och information, på vår hemsidan innan den fryser kl. 06:00.